Cytus II/其他角色
A.R.C.
高层委员会
Leo Smith
| Leo |
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A.R.C高层的委员会的委员之一，直接管理研究部。
因为理念不和解除了Phoenix的A.R.C.科技部门主任一职。
在Noah的记忆复写技术研究即将进入到最终阶段时因为害怕此技术会对A.R.C.不利所以解散了Noah的研究团队，并将其分配到“Zero”部门，至此Noah成为了A.R.C.的棋子。
后来下令对勘探队Eagle-01发现的十号机进行实验，但没有任何收获，再加上Sagar对实验的极力反对，最终才决定给十号机以人类的身份在A.R.C.工作。
为了剿灭Light组织而策划了机械兽失控等一系列事件。了解甚至参与了A.R.C.的人体实验。似乎有着更大的野心。
Leo从Light组织事件发生后就一直在调查A.R.C.隐藏的秘密并掌握了相关情报，最终于N.A.702.12.17威胁Violette使她将所有权限转移给Leo。至此，Leo掌握了A.R.C.的最高地位。然而几天后Vanessa发动了暴乱，Leo在慌乱中下令消灭所有建造者，间接导致了Ivy的死亡。
研究部
Noah Black
Helena的丈夫，PAFF的姐夫。
就职于A.R.C.的科学家，在Phoenix被辞退后接替了他研究部主任的职位。研究的重点项目是“记忆复写”。但后来由于高层害怕此技术会对公司不利，他的研究团队被解散，他本人也被分配到“Zero”部门担任主任。
曾对Aroma抱有非分之想并在醉酒后袭击过她，但并未对Aroma造成“真正的伤害”。在Aroma发生车祸后用自己的技术将她救活，一直以来都对自己的行为感到十分后悔，现在他真心希望姐妹两能够幸福。因为不想让Aroma想起被袭击的经历，所以在移植记忆时没有将那部分的记忆植入，导致了Aroma后来的记忆错乱和恢复。
702年12月8日时被Ivy绑架，并被她要求将Vanessa的核心资料复制到她偷来的建造者机体中。但是实验失败，Noah自己也被打成重伤。最后Ivy将其放入医疗舱中治疗。
即便重伤也还是在程序里动了手脚导致Vanessa的攻击暂时停止，为外界的人（包括Ivy）争取了一小段时间。
702年12月29日时被前来地下室取钥匙的PAFF一行人发现，后为了拖延住Vanessa被建造者攻击而牺牲。
IT部门
Davis
Xenon的上司，A.R.C.网络安全部部长。
Mark Mendes
Xenon在A.R.C.的同事。
曾经是隶属于管理局IT部门的工程师，性格孤僻而有着强烈的正义感。为了调查电子毒品的真相与ROBO合作，破案之后收到了A.R.C.网络安全部长Davis的邀请而进入A.R.C.。调查过程中注册了一个叫“MMaster”的iM账号，破案后账号就被他注销了，在与Xenon成为同事后某一天两人闲聊，Mark被对方吐槽讲话方式像某个iM账号。
生物科技部门
Daisy Brown
| Daisy |
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 Daisy（左）和Rin（右） |
生物科技部门的女研究员，负责设计机械兽的习性系统，也对其进行意识模拟。
金发碧眼，扎双马尾。性格大大咧咧，有些天然疯。
与同事Gordon关系不错，喜欢叫他"Gordy"。
隐藏身份为Light的成员。因为背负着对姐姐Bella死亡的愧疚才选择加入Light。尽管她与Warner在理念与行事风格方面都有巨大的差异，但是两人还是一起参与了整个机械兽失控事件。
Daisy受姐姐的理念影响，是真心希望用科技来造福人类，所以在进入A.R.C.后更希望留下并脱离Light，于是她便答应协助Warner完成几项任务，包括让机械兽失控、取得Rin分析完成的资料等。在接触Rin后想起了曾经自己的信念而想要改过自新，但试图陷害Eagle-01小队的行为已被Gordon揭发，最终被A.R.C.逮捕。A.R.C.的官方文件对外声称其已被解雇。
实际上Daisy被逮捕后并没有被送往管理局，而是被带到了A.R.C.的秘密研究室。她的后脑被植入了利用精神网络技术开发的芯片，最终沦为A.R.C.的人体实验中的一个实验品。
Gordon Walker
生物科技部门的研究员，负责设计机械兽的能量输出系统。
不喜欢Daisy以“Gordy”来称呼自己。
受到Daisy的照顾和帮助后与她一同进入A.R.C.，对Daisy有好感。A.R.C.的官方文件声称其在Daisy被解雇后自愿提出离职。
与Leo有交易，“以协助公司逮捕Light为条件，换取赦免Daisy Brown的罪”。为此，他调高了机械兽的控制数值、在全像仪中放入爆炸物，并将一切栽赃给Light，营造逮捕他们的正当理由。
实际上在Daisy被逮捕后试图与Leo谈判，但谈判失败，最终被带到了A.R.C.的秘密研究室。他的后脑中被安植入了利用精神网络技术开发的芯片，沦为A.R.C.的人体实验中的一个实验品。
勘探队
Colin Neumann
ConneR的父亲。勘探队Wolf-01的队员。
被其他同事形容为“铁打的汉子”。
在682年的勘探任务中与其他队员一同遭到建造者的袭击，最后只有他一人生还。在他将要把小队被袭击的真相告诉队友Luka的家人时却遭到A.R.C.上层阻止，还被公司辞退并长期监视。此后就沉迷于对Neumann家族祖传芯片的研究，但是进展并不顺利，脾气也因此变得十分古怪，还会家暴自己的妻儿。
最终于702年10月去世。
Luka Thakker
Sagar的父亲，勘探队Wolf-01的队长。
每次出任务回来以后都会给年幼的Sagar讲述封锁区的各种见闻，渐渐地使Sagar对外面的世界产生了向往。
认为即便个人的力量不足以推翻或改进体制中的漏洞，但在错误的环境下做自己认为对的事情，总有一天也能一点一点地改变这个世界。
在682年的一次勘探任务中为了保护队友Colin Neumann撤离而被建造者攻击致死，死前留下了记录了事件全过程的影像。而他的死因也被A.R.C.高层所封锁。
Edwards
勘探队Eagle-01前任队长，Sagar、Alex和Bruno的教官，与Luka是旧识。
Alex Flynn
勘探队Eagle-01队员，擅长近战。
红发金瞳的青年，绰号“豺狼”。
学生时代曾经霸凌过Xenon的妹妹Shannon，后来因为在暗网进行毒品交易而被匿名者（很可能是Xenon）举报。从管制区出来后在地下格斗场打黑拳。
最初因为打黑拳与Sagar相识，并且对他关于勘探队的描述很感兴趣。后比Sagar早一年进入训练营。
洞察力很强，可以敏锐地感知到一个人身上的气场及其发生的变化。
非常怕虫子，甚至连虾都不敢吃。
貌似喜欢Lucy，经常会和她拌嘴。
Lucy
| Lucy |
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勘探队Eagle-01队员，在队内负责支援和侦查。枪法很准，擅长狙击。
绰号“冰沙妹”。Lucy并不是其真名，真名未知。
黑发绿瞳的女性，平刘海，头发扎成高马尾。
父亲和哥哥都是盗墓者，并且都被Sagar的相关者所杀。最初进入勘探队是为了向Sagar复仇，结果反被对方一顿好言相劝，最后加入了Eagle-01小队。
在逐渐了解Sagar的为人后开始对他产生好感。
Bruno Heart
勘探队Eagle-01队员，负责队内的技术支持。同时，他的观察力与情报收集能力都很出众。
褐色皮肤、身材魁梧的青年，左眼上有一道伤疤，绰号“大B”。
最初与Sagar和Alex因为要共同执行任务而相识并成为了朋友。
自称为“队长的头号参谋”，有私下收集情报的习惯。
貌似隐藏着一些秘密。实际上Bruno是Leo为了防止Sagar对Luka的死亡进行深究而安排在Sagar身边的监视者，每月需要定时向Leo汇报Sagar的行踪。后来Bruno对Sagar有了更深的了解后立场上偏向Sagar，认为没有继续监视和汇报的必要。但这个请求还是被Leo拒绝了。
Gary
勘探队Eagle-01队员。
Jack Edwards
勘探队员，于680年在08境外的封锁区因终焉病毒而殉职。他死前曾挖掘出能将 无人机LE-110 的故障排除的资料，但讽刺的是在他死去的同一天，管理局的无人机LE-110发生故障将员工Carly Pauline杀死。
其他职员
新岛(Shinshima)
A.R.C.聘用的研究学者，人工智能研究计划的参与者之一，来自Node 15。
与ConneR在人工智能领域有过合作。
曾帮助Sagar提交保留机械兽的提案。
Nancy
A.R.C.室内酒吧的调酒师。
Hardy Calder
Calder夫妇的儿子。年幼时因发现了父亲出轨的事情而对父亲冷眼相待，此后父子关系十分恶劣。
长大后成为了A.R.C.的员工，但在入职不久后就莫名染病而死。
Meg
仅在CG中出现，逮捕了Daisy的A.R.C.员工之一。
Max
仅在CG中出现，阻拦Gordon的A.R.C.员工。
员工亲属
Lester Calder
| Calder一家 |
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Sagar购买的全像仪所在店铺的店主，是Nelly的丈夫和Hardy的父亲。
Nelly Calder
Lester的妻子，Hardy的母亲。
Alyxia Neumann
ConneR的母亲。对ConneR十分温柔。
后来因为无法忍受丈夫的家暴而离家出走回到娘家。
Riya Thakker
Sagar的母亲。喜欢叫Sagar“猪脑袋”。
实验体
A.R.C.高层Violette为了测试利用病毒控制人类数量的可行性而策划了秘密实验，这些是被用于测试终焉病毒的实验人员。下述二者根据Vanessa的OA空间文档可知，是初步实验的16个实验体中仅有的存活者。
E00195
实验体之一。被注射了95%的终焉病毒，于25秒后死亡。
E00200
实验体之一。与E00195一同被注射了95%的终焉病毒，虽然陷入了昏迷但生命迹象稳定。即使被高强度电击也没有任何回应。随后被发现为终焉病毒的免疫者。A.R.C.高层在他身上进行了精神网络的测试，但E00200此后已经昏迷了数年，脑波维持着稳定中偶有起伏的状态，与cyTus的整体数据浮动接近一致。该高层人员推测E00200在精神网络中已经拥有了极为强大的控制权，虽然意识接近溃散，很可能失去了原有的记忆，但也许能利用观测到的数据，运算出物件、人格、甚至封闭的空间。Vanessa虽然刚开始对E00200的存在表示不满，但在Violette向她保证E00200始终在掌控下之后，Vanessa便接受了这名人类的存在。
 以下内容含有剧透成分，可能影响观赏作品兴趣，请酌情阅读
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| 实际上这位E00200就是玩家，也就是剧情中的You。下文中的“玩家”指代E00200。
玩家的初次苏醒其实就是游戏最开始的那段动画——PAFF在推文的编辑区里写下“Who am I？”的时候。之后PAFF将它改为《Kanata》的新曲发布通知。从那之后，玩家便一直在OS空间内观察PAFF以及相关者的一举一动，并且自行构建了OA空间用来梳理自己收集到的资料和信息。 在4.0版本中Vanessa剧情的最后，玩家看到因为Ivy的死亡而几近崩溃的Vanessa后，于OA空间中创造PAFF以及Vanessa的仇恨人格用以了解其目前的状况，引导玩家进行数据的分析。 也就是说，表面上是PAFF和Vanessa对玩家的解释和劝说，实际上是玩家自己的精分现场 随后玩家会因为突然涌入的情感而暴走其实就是打剧情谱面。玩家平静后，恰好接收到了PAFF向你求救的通讯。两人就此离去，并且告知玩家已经有了决定未来的力量——玩家已经演算过了无数遍结局的走向，浮窗中显示着各种未来的景象绝大多数是阴乐逝界的图片，是拯救人类还是毁灭一切，都取决于你。 值得注意的是，早在3.0版本中，GE结局开头便是PAFF唤醒玩家，玩家睁开眼睛的画面。在当时这段剧情没有引起太多人的注意，现在回头去看，是否能认为E00200在Vanessa死亡后，与Xenon的妹妹Shannon一样逐渐摆脱了精神网络的控制，并在现实中醒来了呢？ 通关4.0版本的结局后，在PAFF、NEKO#ΦωΦ、ROBO_Head以及Vanessa的OA系统中，对物件的描述将会由原先PAFF/Vanessa的仇恨人格的想法转变为E00200的想法。 Vanessa·蓝花的O.A.文件就是玩家退出OA空间的指令，看来应该是醒来了 |
管理局（Node 08）
成员
Kyle Jackson
| Kyle |
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Xenon的父亲。Node 08管理局的执法员。
Nate Martin
管理局武装执法部队A小队的队长，Kyle同事Martin的儿子。
在Xenon越狱时和后来Node 08发生了大规模的建造者袭击时都帮助过他，但在最后因为执行管理局的任务而开始不信任Xenon，他手下的其中一名队员还将Ivy射杀。
Carly Pauline
Cherry的母亲。
曾在管理局运输站工作，是跨Node运输系统的管理人员。拥有美妙的歌喉。
680年12月9日，Carly在下班途中意外被一台失控的无人机打成重伤，在被送到医院之前失血过多不幸身亡。
Andrew Wood
执法队第三小队队长。
Zoe Watson
执法员，管理局“渗透计划”的成员。
与ConneR是同级生。学生时代的Zoe是永远的年级第一，也是当时ConneR的目标与精神支柱。之后Zoe提前毕业进入管理局成为了一名执法员并参与了“渗透计划”。
员工亲属
Doris Jackson
Xenon与Shannon的母亲。
Shannon Jackson
| Shannon |
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Xenon的妹妹，生于N.A.682.05.30。和哥哥一样是金发蓝瞳。
会画画，曾经因为喜欢昆虫而在学校被霸凌。
696年时Shannon被Luis劫持，因为受到过度惊吓的同时使用精神网络报警而患上了“精神网络相关电子创伤症候群”，一直在医院疗养且不能和任何人接触。除使用镇静剂以外，只有在Xenon带上头盔给她弹吉他的时候精神才能维持在稳定状态。
GE中提到在Vanessa事件过后逐渐脱离了精神网络的影响，病情得到了好转。
单声演艺
Helena White(Helena Black)
PAFF的亲姐姐，Noah的妻子。
比PAFF大8岁，生日是4月20日（可推出出生于N.A.670.4.20）。
姐妹俩从小相依为命，而Helena对妹妹有一些过度保护。
后来成为了PAFF的专属经纪人。
Ruby
前辈级别的职业歌手。单声演艺旗下的艺人之一。
在KAI和JOE刚开始玩团的时候给予过他们指导。
Cherry PuNK
| CherryPuNK |
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Frank
Cherry PuNK的贝斯手。应该只是凑巧与给ConneR做了截肢手术的医生同名而已。
LUMY
Cherry PuNK的键盘手。
Dannis
Cherry PuNK的鼓手。
黑帮
玖凰会
Phoenix Wyle
科学家，原A.R.C.科技部门主任。因为A.R.C.高层无法接受他的理念而被辞退。之后他为了能够继续研究终焉病毒而前往Node 03创建了地下科学组织“玖凰会”。
发现了能够和病毒共存的Nora之后，Phoenix对终焉病毒的实验取得了一定的进展，在此过程中他也渐渐地对Nora产生了感情，把她当成自己的女儿来看待，并希望Nora能过上正常人的生活。
最终因为掩护Nora等人逃离而被Kim所杀。
金(Kim)
Node 02的科学重罪犯，被Phoenix救出后成为了玖凰会的成员之一。
主要研究的项目是肢体强化，甚至认为用婴儿做实验效果更好。他自身的肢体也已经被大幅度强化过。
非常嫉妒Phoenix，在偷走玖凰会的化学元素拿去倒卖的事情被Nora揭发后转投虎盛堂。
后将Phoenix杀死，潜逃到别的组织却被龙抓回玖凰会。此前Kim已经在体内放置了大量含有终焉病毒的胶囊，他想要将病毒散播出去来毁灭Node 03，最终在计划得逞前被Nora开枪射杀。
村田一郎 (Murata Ichiro)
坂井大吾(Sakai Daigo)
土龙
水名月龙(Ryu)
土龙的大当家，Node 03安全理事会会长。迷信风水学说。
林文生(Manson Lam)
Node03管理局局长，科学家，也是土龙的二当家。十分赏识Phoenix。
在698年被为了保护Nora而暴走的ROBO_Head误杀。
Diego
土龙组织的成员，被试图为Cherry报仇的Xenon杀害
Cafe
Saxon
JOE的舅舅。JOE称呼他为“老爹”。
其他
Augus
Hunter
Luis Pauline
Cherry的父亲。
曾经是管理局运输站的工程师，在妻子Carly遭遇意外后就辞职并拒绝了所有管理局的补助。之后便沉迷酒水与赌博，过着浑浑噩噩的生活。
后来Luis被赌场的组员发现，他便开始利用自己曾经对地下通路、巡逻机路线的了解来协助黑帮进行走私活动。
在696年时将执法员Kyle杀死并因此被逮捕，后在狱中反思了自己的行为。
建造者
Lina
机体编号"OPCI_2404_L"，半觉醒者。名字是Ilka起的。
和Ilka一起发现了已觉醒的Ivy和Vanessa（实际上Vanessa只是半觉醒）。
一直在试图克服“亥伯里翁协定”的控制，对于Ilka只看结果的行事风格十分不满，认为Ilka不信任半觉醒者。
曾和其它几个半觉醒者一起试图劝说沉睡者起来反抗人类，结果被沉睡者识别为错误机体而遭到破坏。
经由此事，Ilka彻底放弃了所有半觉醒者。
Violette
| Violette |
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分析型建造者，眷顾者，Ilka的追随者之一。
复兴工程时期的机体编号为"OPCI_2177_I"，外貌为黑色长直发、金瞳[1]、留中分刘海的女性。
N.A.400年被重制后作为分析型建造者被分配到某实验室工作。本想帮助欠债的实验员Ken结果却被对方出卖用于抵债，遭到了性暴力，向他人救助却被忽视，进一步加深了对人类的怨恨。后来被Jill所救并回想起了重制前的记忆，因此更加坚定了消灭人类的想法。对Jill抱有好感。由于对取回记忆后的Ilka的行动持怀疑态度，时常拿Jill的死亡提醒Ilka不要忘记她的目的，且私下里召集了其他建造者，打造了一个备用计划，即排遣建造者混入社会中制造混乱，通过挑起人类之间的斗争为建造者的介入提供机会，招募其他觉醒者，同时研究当年Ivy留下的代码，企图通过亥伯里翁协议控制沉睡者，从而对人类造成重创；同时提前洗脑了一些人类作为眷顾者的信徒，作为最后一道保险。
芯片计划失败后，Violette发动政变，迫使Ilka转交指挥权，随后与其他眷顾者到达Shelter，覆写了亥伯里翁协定，使建造者开始攻击人类。然而Violette等人却被Hedwig带领的精英小队突袭，其他建造者被全数歼灭，Violette也只剩头部，供能系统完全失效。Ilka发现Violette后将她带回了Shelter，为她供能，使她得以利用被洗脑的人类从Shelter中逃脱。很快，A.R.C.成立了，Violette作为A.R.C的实际最终领导者躲在暗处，而高层自然都是被洗脑的人类。Neumann家族成为人类最后的堡垒的同时，A.R.C.也成为了Violette的方舟。
Ilka在停机前试图利用Shelter内的设备向她传输记忆单元，然而由于Shelter电路规格与建造者差异巨大，强制供能使Violette的电子脑发生异变，因此她苏醒后无法完全复原Ilka留下的音频内容，自然无法得知Ilka最后对于人类和建造者之间的关系的感悟。到最后都无法理解Ilka的Violette最终还是踏上了向人类复仇的道路。
在Vanessa苏醒后与其达成合作关系，进一步控制人类，却被Leo威胁而将所有权益转给Leo，在Vanessa暴走后遭到恼羞成怒的Leo枪击，最后仅有一只更换过的右眼还在运转，只能观察而不能思考。
Jill
| Jill |
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Enforcer型建造者，也是眷顾者，Ilka的追随者之一。
复兴工程时期的机体编号为"OPCI_2503_III"，外貌为银色齐肩短发红瞳、留进气口刘海和Half-up发型的女性。
新纪元四百多年时，Jill（极有可能）作为第一个觉醒的建造者，在OPCII_2052_II（实际就是Ilka重制后的机体）觉醒前代行Ilka的角色，唤醒并召集了眷顾着们。对Ilka抱有好感，即使Violette三番两次地提出将未觉醒的二号机铲除以免影响计划也不愿意放弃。在与Rald Neumann一行人于地下设施对峙时被Marcel射杀，唤醒了Ilka。
OPCⅡ_2052_Ⅱ
| 二号机 |
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Enforcer型建造者，也是当时管理局所属的执法员，昵称二号机。
外貌为白色短卷发（内层头发可能是黑色），绿瞳，身着执法员服装的女性。
实际上就是在新纪元四百多年时被重置为二型建造者的Ilka。
OPCII_2108_I
Violette麾下的觉醒者之一，男性。暂时还未提及名字。对Ilka抱有较高的信任，但依旧参与了Violette的计划。性格较为弱气。
Violette发动政变后负责监管Ilka的行动，但心中对Ilka的信任以及Ilka的信念让他决定放Ilka走。
Crystal PuNK
KAI
Crystal PuNK的成员，担任鼓手。
Node 03出身，在CP团解散后回到了03继承了家里的乐器店生意。
有收集新闻信息的习惯。因为03失踪人口很多，自己也帮忙找过人。
在Xenon和Cherry来到03后为两人提供庇护，自称是“03罕见的优良市民”，所以“包庇两人大概是他做过最坏的事了”。
在音乐方面是隼人的老师。
其形象参考了现实中的KIVΛ。
反科技组织"Light"
Warner Swift
Node 03出身，反科技组织"Light"的领导者。
在机械兽失控的事件发生后开始调查Rin相关的资料，并相信她不是简单的存在，甚至有可能是对组织起到重要作用的人。
后来被Eagle-01小队逮捕，被收监后逃脱至郊外，但最终被Violette指派的建造者杀死。临死前都坚信这一切是A.R.C.的阴谋。
Bella Brown
Warner的联络人，Daisy的姐姐。
原A.R.C.员工，在发现被损毁大半并被隐藏起来的终焉病毒资料后便不再信任A.R.C.，转而和Warner合作后被杀害。从剧情上可推断Bella之死是A.R.C.所为。留下来的资料即为后来Rin分析的资料。
也是Daisy在与Warner联络时使用的假名。Daisy是背负着对Bella的罪才得以支撑至今。
Aroma的同学们
Clara
J-1班级的班长，模范生，Aroma的同学。喜欢Daniel。表面上是Aroma的好朋友，但实际上却不喜欢她，在Aroma被同学欺负的时候选择了袖手旁观。后来为自己当时的行为感到后悔。
现在是Daniel的女朋友并且两人已经同居。
Daniel Evans
J-1班学生，Aroma的同学。也是模范生，但是脾气暴躁并且操行不好。学生时代对Aroma有好感。
现在成为了一名小说家并且在与Clara交往，两人已经同居。
Iris Baker
| Iris |
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Aroma的同学，也是她的好闺蜜，两人自幼便相识。从学院毕业了以后搬到了Node 19。
之后偶然在cyTus上碰到了乔装的Neko。Iris知道此时的PAFF经常和Neko同时出现，因此希望Neko能帮她带话给PAFF，却被对方当成是变态。后来误会消除，Iris的心愿在Neko的帮助下得以实现。
因为形象都是麻花辫+圆框眼镜，Iris在Rin实装之前被一些玩家猜测和Rin是同一人
朝仓家
朝仓康平(Asakura Kouhei)
Neko的父亲，与咲离婚后带着Neko来到08生活。
和Neko关系很好，被Neko称为“笨蛋臭脚王”。
朝仓幸子(Asakura Yukiko)
Neko的继母，也是健太的母亲。最初是康平的下属，后来与其结婚。
虽然刚开始并不被Neko所接受，但一直都对Neko很好。
Neko评价她“漂亮温柔而细心”。
朝仓健太(Asakura Kenta)
Yukiko的儿子，Neko的义弟。是PAFF的粉丝。
其他
Vicky Russell
报社"Daily 08"的记者。非常擅长寻找八卦消息，有很强的侦查能力。
曾在“Node New Networks”工作，但为了自己心中的目标而辞职。也曾是富有正义感，为了真相而不顾一切的记者。
最初报导了很多与Xenon相关的负面新闻，但最后还是通过媒体还了他一个清白。
楠隼人(Hayato Kusu)
报社"Daily 08"记者，薰的青梅竹马，678年10月01日生，24 岁，A型血。
在音乐方面师从KAI学习打鼓，是乐团“ICECREAMFLY”的鼓手（代打）。
南宫薰(Minamiya Kaori)
与芳奶奶和Hayato一起生活在Node 03的女孩。性格坚强，同时也是个天生的歌手。
喜欢唱歌并且与Hayato组成了乐队，梦想是能去到Node 08表演。
在694年4月25日的晚上失踪。
后来被拐卖到Node 08，被Noah找上，作为“容器”接受了当时已经濒死的Aroma的记忆，而原本薰的记忆被删除。但因为Æsir演唱会对PAFF精神造成的影响使得她关于薰的记忆逐步浮现。
从03运输到08期间，薰被终焉病毒感染，原因可能是她暴露在终焉病毒的环境下，但她没有死亡而是觉醒了“荷鲁斯之眼”的能力。
PAFF正式出道是在她遭遇车祸之后，因此PAFF实际上可以相当于Aroma的记忆+薰（找回记忆前仅限薰的身体）。
黄芳(Feng)
Kaori和Hayato的收养者。在Node 03经营着一家花店。
在薰失踪后变卖了所有家产寻找她，未果。后来中风住院时在经过隼人的同意后参加了玖凰会的实验。但是最终因为实验失败而过世。
临终前被恢复了嗅觉和触觉，隼人通过薰衣草瓶子和护士小姐的帮助让芳奶奶以为“薰回来了”而安然离世。
白石咲(Shiraishi Saku)
Neko的生母。现在与Neko的外婆Mayu一起住在Node03。曾经在古畑慈善机构工作。
Linda
Neko在Node 08认识的好朋友，和Neko一样喜欢音乐。是Crystal PuNK的粉丝。
后来成为了Live House"Under Velvet"的行政员。
山田(Yamada)
隼人的老同学。带着隼人去玖凰会偷东西时，抛弃了隼人，导致隼人被抓住，间接帮助芳奶奶接受医学试验（无误）
在偷窃其他帮派的金属元素时与ROBO相遇，带着他前往玖凰会。然后被Nora抓走了……
大哥吃葡萄
Vivian Rose
被Ivy救下的失足坠塔的小女孩。
在后来发生的建造者复苏事件中，她的父亲遭到建造者的杀害，自己幸存下来。事件结束后进入了孤儿院，与Neko有交流互动。
Miles Durand
Ivy在墓园碰到的老人，与Ivy聊了些自己妻子Lilian(Lily)的事情。
Grace Garcia
Neumann家的管家。
Sasha
职业欺诈师，代号是"Shark"。外表为褐色妹妹头、金瞳的女性。近在690年3月的一次失败的交易后与ConneR“偶遇”，两人作为搭档开始合作。
真实身份是执法员Zoe Watson，为了揪出犯罪组织安插在管理局的眼线，她隐藏了自己的执法员身份，还做了许多黑活。但本人很想摆脱这样的生活。
在690年7月某次交易失败后听取了ConneR的建议去Node 10避风头[2]。后来回到了家乡Node 13，匿名发表关于古文明的研究资料。
Vanessa暴走时参与了对逃到Node 13的难民的安置工作。
Good End里最终与移居到Node 13的ConneR一起继续探寻古文明的谜团。
Matt
出现在CG中，与Alex一同欺凌Shannon的另一名学生。
根据Alex的经历推断，Matt很可能就是Sagar口中的“死在地下格斗场的Alex的同伴”。
Ilka相关
Rald Neumann
| Rald |
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 《Levolution》的曲绘，Rald（前）和Ilka（后） |
Jonas的独子，ConneR的祖先。在Node 13被奉为英雄一般的人物，直到现在他的后代都备受当地居民的尊崇。
Jonas Neumann
Rald的父亲，Neumann企业的领导者。造成了Node 13的资本化和阶级化，实际上是为了以名声和权力筑起高墙，保护Neumann家族保存下来的资料。虽然和Rald在某些方面的观念不同，但依旧爱护自己的孩子，在见证到Rald的成长后认为他有能力做到自己没法做到的事而寄予厚望。于NA494.12.06被觉醒的建造者们绑架到底下设施，见到Alain和Eliane后发疯似的撞墙直至身亡，据Violette所说是因为愧疚感而自尽。
Tim
Neumann企业的前保安队长。被Jonas指派为Rald的贴身保镖，训练他的生活、学习跟价值观。知道Neumann家族隐藏着一些秘密，但并不清楚具体内容，认为自己没有资格了解。与Rald等人一同潜入建造者的地下设施时因为见到了建造者屠杀人类的场景，产生了对建造者的恐惧而抛下其他人独自逃跑，之后感到十分愧疚，受到Rald的宽慰和鼓舞。于NA495.01.09为了保护Rald等人逃离而留下拖延，最终阵亡。
Marcel
Neumann企业的保安队长。原先是副队长，Tim调任后升任为队长。Rald被通缉后与他一同逃离。在除役事件中与建造者们奋战，最终在Ilka的指令覆写完全发挥作用前战死。
Alain Fischer
Rald的朋友，出身于贫民阶级。因为跑得速度极快而有着“飞毛腿”的绰号。由于家境贫困而经常受到欺负，一开始对Rald抱有敌意，在Rald和Tim救下Eliane后有所改观，之后与Rald成为了好友。即便如此，他仍会从Rald家里偷走一些贵重物品。受到恶棍的胁迫而前往破坏Neumann家族的货运列车，被恶棍留在现场，与二号机相遇时提供了异常建造者的线索，之后被赶到现场的Rald和Jonas遇到，虽然Jonas替他交了保释金，但Rald非常生气并决定断绝往来。列车事故后被异常建造者跟踪并绑架，为了保护Eliane而将她的芯片偷走，装入自己的装置中，最终被洗脑。于NA495.01.05在地下设施被建造者杀死。
Eliane Fischer
Alain的妹妹。要被汽车撞时被Rald所救，促成了Alain和Rald的友谊。与哥哥一起被绑架到地下设施后由于Alain的保护而没有被洗脑，被Rald救出。之后陪伴在Rald身边，时常给予他安慰和鼓励。除役事件过后与Rald结婚生子。
Bing Randolph
被眷顾者们控制并洗脑的人类，在眷顾者们的操弄下在名义上接管了Neumann企业。以保护眷顾者为最高事项，Rald利用此特点对他进行胁迫。在芯片发布会上被Rald等人用电流刺激，想起了地下试验场的事并试图攻击前来稳定情况的Ilka，被Violette击毙。
Hedwig
Marcel认识的地下军火商，女性。因为家人在地下设施被杀害，对建造者抱有很深的敌意。拥有能干扰建造者侦测系统的装置，为Rald之后的行动提供了帮助。一直认为Rald过于软弱，但还是会听从Rald的指挥。芯片发布会后让Rald帮她偷渡进第一象限，随后利用电视台鼓动人们发起暴动，以极端方式开始与建造者们抗争，一定程度上破坏了Violette的计划。她带领精英小队突入Shelter并击溃了Violette等建造者，却被被洗脑的人类偷袭，死在了除役事件中。
Rin相关
矢泽凛(Yazawa Rin)
| 矢泽凛 |
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大概生于N.A.480，生活在两百多年前的人类少女，矢泽研究所所长的女儿。
黑发绿瞳，戴眼镜。视十号机为自己最好的朋友，两人的声音很像。
性格活泼，与害羞内向的十号机形成了对比。
与十号机之间的感情很深厚。最终也是为了唤醒被协定控制的十号机而死于除役事件之中，百年后苏醒的十号机也继承了她的相貌和名字。
矢泽安(Yazawa Yasushi)
矢泽凛的父亲，植物学家，矢泽研究所的所长。
平时忙于工作很少关心女儿，后来死于建造者制造的火灾中。
矢泽亚沙(Yazawa Asa)
矢泽凛的母亲，植物学家。后来死于建造者制造的火灾中。
Mauro
男性形态的眷顾者。
机体编号为"OPCII_0479_VI"。"Mauro"在拉丁语里的意思是“走过黑暗”。
因为接触到了“某个人”而认识到了人类的丑恶，后来开始与其他觉醒者一起挑起人类与建造者间的矛盾。
曾两次邀请十号机入伙，但都被对方拒绝。
在第二次劫持矢泽凛的时候被克也射杀。
实际上早在复兴工程时期就已登场，属于OPCⅠ机型，觉醒日期为N.A.149.04.01，并且帮助Ilka一起修改协定。
川崎克也(Kawasaki Katsuya)
矢泽凛的同学，后来成为了她的男朋友。
最开始对建造者抱有一定好感，但后来因为哥哥被建造者杀死所以变得十分不信任建造者，并因此加入了反建造者组织“Ghost”。
在除役事件中因为保护凛而牺牲。
川崎贤章(Kawasaki Kensho)
克也的父亲，也是“Ghost”的成员。后来和妻子Natsuki一同死于除役事件之中。
联动角色相关
黑崎(Kurosaki)
Vanessa
联动相关剧情详见Vanessa(Cytus)#Cytus Ⅱ
Hilda Turner
| Hilda |
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 Hilda（左）和Hans（右） |
勘探队Eagle-01前队员，Hans现在的监护人，像姐姐一样对待他。
花梨(Karin)
| Karin |
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出身于Node 03的女孩子，喜欢唱歌。“Kaf”的真身（演唱者）。
家里人反对她唱歌于是经常偷偷翻唱且参加选拔而被F发现，一起作为“Kaf”出道。后来自己的电子宠物鱼（拉普拉斯）和F失踪，于是找到ROBO Head请求帮忙。
最后了解到风花（F）的事情并用歌声将其唤醒，后来与风花的亲戚理奈一起进入歌唱进修班学习。
风花（Fuka，F）
| F（虚拟形象） |
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| 风花 |
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女性，根据蒲原的话推测年龄约为35岁（单看外貌只有25）。曾经与蒲原组团顺带一提，团名也叫FUKA……，后因人气较低、理念不合而解散。风花因为声带受损而被蒲原抛弃，几乎与所有亲人断绝关系（除了理奈）。
一直在依赖AI编曲并卖给音乐公司来维持生计，后来找到了花梨并利用她的声音来改进AI，并且把自己演唱时使用的造型（就是花谱的第二形态·青雀）送给花梨来用。
二人合作时间长了之后，风花开始逐渐在意花梨，她现作曲用AI失控后担心Kaf的真实身份暴露，为此甚至亲自进入神经网络试图阻止AI，结果却昏迷不醒。在花梨歌唱后奇迹般地苏醒。
最后与花梨约定继续以Kaf的身份创作歌曲。
蒲原和真（Kazuma）
蒲原娱乐的负责人。15岁时与风花组团，后来抛弃了风花。
为了赚钱而邀请ROBO Head来参加音乐祭，对ROBO谎称原本的DJ不能来而让他开场。在拉普拉斯大闹现场后认出了Kaf（花梨）的造型，以为花梨是风花来报复他而派来的人，结果被ROBO Head反过来逼问出关于风花的情报。ROBO Head宣称蒲原会为自己的所作所为付出代价。
理奈(Rina)
| 理奈 |
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风花的亲属，不久前搬到Node 03，在因缘际会之下与风花联系上并熟识。在Kaf到来之后告诉了她风花的真实身份，最后与Kaf一起进入歌唱进修班学习。
形象可能源自神椿企划的另一位虚拟歌手理芽。
拉普拉斯
Kaf身边的那只宠物鱼（外观建模被花梨弄得非常掉san）。
后来风花用来合成音乐的AI因为接受了过多Kaf（花梨）的歌声而暴走，意外转移到了拉普拉斯身上并夺取控制权。此后拉普拉斯在cyTus里追踪Kaf的歌声并袭击其它用户，执行着“追踪并且听Kaf的歌声”这一底层命令。
在ROBO Head的音乐祭上出现并引起用户恐慌，被Kaf用歌声平息，同时因为无法处理真实音乐而程序崩解。碎片代码在底层重新聚合后，被追踪而来的ROBO Head找到。ROBO Head因为自己记忆缺失的缘故而对拉普拉斯产生同情心，为了保护拉普拉斯不被系统删除而打开后门，让它进入OS空间，再自行删除了与Kaf和拉普拉斯有关的一切记忆数据。
最后，拉普拉斯以人类形象行走在OS空间，听着碎片代码中承载着的Kaf的音乐，与「观测者」——那个游走在OS空间中而毫无感情的人短暂聊天后告别。
能天使(Exusiai)
凯尔希(Kal'tsit)
W
零（0）
Caretaker型建造者，机体编号为OPCⅡ_0217_IX。按理来说应该叫他九号机，但Akira博士却给他起了“零（0）”的名字并称呼他为零号机。
最初由Node 03社区照顾部派来照顾博士，在被对方无视后却对他的画作产生了兴趣并且看得入了迷。此后也一直表露出对博士画作的兴趣。某一次零号机在阁楼上偷偷看名为《Terra》的画作被博士发现，他便在博士的要求下说出了他所看到的画面的内容和他自己的感受。自此以后，博士便开始与零号机分享他所构建的画中世界的故事，零号机便以博士的画为基础将这些故事转换为数位资料库，从而构筑出博士心中的幻想世界"Terra"。
除役事件发生前一年时，觉醒者Mauro发现了觉醒的零号机并一直试图拉他入伙。Mauro最后一次对零号机游说无果，最终只得放弃，并指出了他是半觉醒者的事实。
后来除役事件发生，无法脱离协定的零号机在被控制的状态下亲手将博士杀死。零号机意识恢复后看着博士的尸体悲痛万分，发誓要将博士的梦想变为现实。但之后协定又再次遭到了篡改，零号机在新指令的控制下前往封锁区自我摧毁。但是此前零号机将自身机体待机，电子脑与资料库同步连结，所以尽管他的机体被毁，意识还是能够作为数据暂时保存下来。在零号机的意识消散前，他在构筑出的Terra中和“博士”进行了最后一次的对话，之后便陷入了沉睡。
但随着Terra的景象不断丰富，零号机的记忆又重新成型，产生了人格并找回了之前和博士共度的记忆。
Akira
被（建造者管理）系统认定为拥有高度艺术才华和反社会人格的画家。也被称为Akira博士。
光(Hikari)
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