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超速决斗部的成立（第27集）：
游我一早便到了学校，在学校天台上回忆着和尼尔的决斗，见到学人和露明后，向两人道了谢并表示如果没有几人的极限卡，自己说不定已经败给尼尔了。此时改造突然出现告诉游我等人大事不好，学生会室被卢克“占领”并取名为“卢克部”，卢克邀请众人加入但全部失败，游我以“社团什么的好麻烦”回绝，其余两人也以其他理由回绝。
后来卢克多次邀请别人加入一律失败，将自己关在了学生会室里。放学后游我和露明还有学人前去部室，在门口偷听到了卢克和「幻影卢克」的决斗，三人推开部室房门表示自己是前来加入社团的，社团的成立手续已由学生会代为完成，而社团顾问则拜托了塞巴斯蒂安担任。目的为推广超速决斗的“超速决斗部”也正式成立。
决斗大赛前的合宿特训（第28、29集）：
某天卢克在进行抽卡的练习时候得知了有一场超速决斗大赛将要举办，于是打算叫上全社团去进行合宿特训。游我在训练途中为了追赶一只公鸡误入到了丛林，在这里见到了一位抚摸着挖掘机的灰发少女别问为什么是挖掘机，这也是一种浪漫（），少女将自己的挖掘机称为“R6”并表示R6不知道怎么了突然就不动了。游我帮助她修理好挖掘机后，少女自报家名为“六叶麻奈”，自称重机骑士。游我询问麻奈是否能让自己也试着操纵一下，麻奈获得了R6的同意后欣然同意。
于是两人骑着挖掘机带着公鸡在花田间十分生草浪漫地转了一圈。这里一转少女番，不止画面连BGM也一起）。
回到宿舍后游我向宿舍的众人提起自己在丛林中遇到麻奈和她的挖掘机的事，学人认为麻奈是属于哥哈第六小学的重骑决斗社团的学生，根据他所听到的传言，在精英云集的第六小学，重骑决斗社团也是其中翘楚，甚至拥有凌驾于学生会之上的权利。此时恐龙部的众人也表示他们的挖掘场地有好几次都被六小重骑部的人强硬抢走，但游我觉得麻奈并不像是那样的人。游我等人的讨论声被中断，露明和同样来自哥哈第三小学的卷寿司子因为电视节目的原因吵得不可开交，后来游我推荐用超速决斗解决问题。第一天在两人最后的和解中渡过。
第二天几人起来发现宿舍的周围被挖出了一大圈深不见底的坑，游我让改造君飞出去寻求塞巴斯蒂安的协助，于是四人在存粮都在前一晚被卢克吃光的情况下等待救援一直等到了太阳下山，被六小重骑决斗部的人救助。你问我改造在哪？改造和塞巴斯蒂安打到了天黑（）。
决斗大赛其实是吹奏大赛？！（第30集）：
合宿过后，学人向游我和露明解释学生会的其他两人七星兰世和七星凛之介之所以没来合宿是因为去了温泉旅行。此时卢克拿来了决斗大赛的报名表，三人凑上去一看才发现这并非什么决斗大赛报名表，而是喇叭二重奏大会。而游我像是想到了什么，表示二重奏大会不也挺有趣的嘛，而且弃权也太可惜了。最后基于多方面考虑，几人决定去找学校的吹奏乐部帮忙特训。
众人在进入部室后，经过一连串木头人和暴力拆迁的惊吓，见到了吹奏乐部的部长，同时也是卢克的姐姐的上城大华。在得知游我等人的来意后，大华表示可以帮助众人特训，但前提是要用格斗技赢过她再说。游我向大华提议用超速决斗来决定输赢，大华欣然接受。决斗途中，大华询问游我，“决斗，名为战斗的道路，在那尽头你期望得到什么呢？”游我答道，从自己创造出超速决斗的那一刻，想法就从未改变过，自己在那尽头期望得到的东西便是笑容。
决斗的最后，大华和游我两人在精神世界交流别问，问就是互相共鸣的决斗者之间特有的交流。大华表示在卢克输给自己后，自己还是有点担心的，但在某天目睹了卢克和游我的决斗过后，久违地看到了卢克开心的模样。肯定了游我“决斗的尽头是笑容”的答案，并相信如果是他，一定能成功走到最后的。
最后按照约定，大华同意给众人上管乐器的入门课，在大华的魔鬼训练下，终于到了吹奏大会举行的那一天……
热爱重骑的贵公主（第31~32集）：
游我等人按照时间带着乐器来到了大赛举办地，然而大赛场地过于破旧让几人不禁怀疑起来。跟着场内的告示顺利走到了赛场的几人，却发现这里的“参赛者”都戴着假面在进行着超速决斗。在场的学生们认出了游我并询问他为何会来到这里，并且对哥哈的无人机（改造君和塞巴斯蒂安）感到害怕，正当游我等人对现在的情况感到不解时，大赛的主办人——有栖川姜戈现身向在场几人说明现况。
姜戈将喇叭二重奏大会称为“暗影大赛”，表示二重奏大赛只不过是个为了掩人耳目的伪名，其正体便是这场暗影超速决斗大赛，同时也说明了游我等人所受的魔鬼训练全部化为无用功。姜戈向超速决斗部的四人表示抱歉，并解释其中有难以言说的苦衷。姜戈原为哥哈第六小学学生会会长，某天他和学生会还有其他热爱决斗的伙伴们败给了学校的重骑决斗部并被夺走了所有的卡片，最后被逐出学生会。而姜戈也因为这次经历有了心理创伤，如果不定时抽卡便会发疯焦躁不安只能说幸好玩的不是氪金抽卡游戏（）。机缘巧合之下，姜戈知道了超速决斗的存在并因为一回合能抽五张卡的原因沉迷其中，为了不被重骑决斗部发现，从此和伙伴们躲在旧校舍进行着超速决斗。
虽然有苦衷，但卢克还是无法放下，因为伪名的原因，自己好不容易熬过去的大华的魔鬼特训全部白费（），游我等人本想劝说卢克一起回去，但被姜戈叫住。姜戈表示能在这里遇上超速决斗的创始人也是一种缘分，提议游我不如和自己来场决斗。此时卢克因为自己拼死的喇叭训练被白费而愤怒到极点，代替了游我和姜戈进行决斗。
战胜姜戈后，卢克对喇叭特训的心结也解开，几人提议一起来办一场盛大的超速决斗大会，然而旧校舍突然被砸开墙壁，在场所有人都被第六小学重骑决斗部“查获”，重骑决斗部部长六叶麻奈也正式登场。经过重骑部参谋之一田崎加里安的解说，众人才得知麻奈为哥哈市里有名的六叶重机的千金大小姐。麻奈对重机有着迷之执念具体表现为听到挖掘机R6美妙的引擎声会脸红）且能听懂重机所“说”的“话”其实就是引擎声。两人互相认出对方并寒暄了一会儿，麻奈称R6说它也很想见游我，R6对游我亲近的情况也让参谋加里安和加山舒贝尔感到震惊。随后麻奈表示要将这里的六小学生全部带走并将旧校舍彻底拆除，游我询问麻奈为什么不能让他们享受超速决斗的乐趣时，麻奈答道重视纪律与传统是六小的立校准则，无论决斗还是重骑都只有原版才是最美的，且认为对这些进行改造的行为是对历史不折不扣的亵渎然而事物总要进步，如果不改造不去发现新方向，我们便无法前进，因此绝对不认同经由哥哈决斗改造而来的超速决斗。
在麻奈准备离去之时，游我向麻奈提出决斗，想要弥补初遇时错过的决斗的机会。根据六小“无论以何种条件，学生都必须接受决斗挑战”的传统，麻奈接受了游我的挑战，并约定如果游我赢了，麻奈便要让全六小的学生都能自由享受超速决斗，麻奈则表示自己的要求等获得胜利后再决定。决斗途中游我看穿了麻奈的心思，表示麻奈也和自己一样，认为这是一场快乐的决斗吧。麻奈虽没回答，但游我享受决斗的笑容让她想起了某些事情。
决斗接近尾声，麻奈召唤出了本不可能存在第三只的极限怪兽——「幻龙重骑 超掘机幻龙」击败了游我。麻奈决定了自己的要求，那便是要求超速决斗部四人转入哥哈第六小学。此时本应去了温泉旅行的兰世和凛之介跑来，解释自己并不是去了什么旅行而是输给重骑决斗部后被强制转入六小。学生会和超速决斗部短暂的六小生活将要开启……
复杂又短暂的转校生活（第33~37集）：
第六小学严守纪律，学生早起集合后要在6点66分前从校舍到达学校，期间需要跨越许多障碍，让游我等人苦不堪言。姜戈解释自重骑决斗部到来后，六小学生的每一天都是这样。在手机被没收，无人机禁止使用的情况下，原七小的众人没有任何求救手段，再加上六小所在位置偏僻，逃跑对于几人来说也是很困难的事。游我开始思考为何麻奈不惜借用二重奏大赛的报名表误导他们到旧校舍，再一网打尽顺便让他们转进六小的原因加上原剧这里的解释，游我八成一早就看出端倪且为了调查，故意掉进陷阱的）。
为了调查真相，游我暗中救出改造君并让对方伪装成学生协助在校内搜索情报，放学时改造君将找到的情报告诉游我后，游我决定去一趟重骑决斗部作为六小的学生向重骑决斗部发起挑战，然而被监视众人的加里安阻拦了。为了回到七小继续就任学生会长，也为了给兰世和凛之介报仇，学人主动向加里安发起挑战。
最终学人赢下了这场决斗，加里安的重骑也宣布报废，几人本以为这样子就可以回到七小的时候，麻奈现身再次拦住了游我等人。由于游我使用校内明令禁止的无人机，又在校内到处散播些稀奇古怪的道具帮助学生解决上学路上的困难，麻奈认为这践踏了六小的传统，于是决定将众人送去废弃宿舍。不过麻奈此举正好达成了游我的目的，卢克先前对极限怪兽的猜测点醒了游我，翻阅了六小的历史过后，游我断定重骑决斗部的秘密便藏在废弃宿舍隔壁的矿山温馨提示：这种矿山矿洞什么的没有防护装备或专业人士在场，绝对不能贸然进去，更别提小孩子了。这是动画，不要学游我他们（雾）。为了更加了解麻奈极限怪兽的来源，第二天游我便将塞巴斯蒂安和改造君送出六小，让他们去避风港寻求尼尔帮助。改造君那边成功逃出六小范围后吸引了决斗部的注意力，于是趁此机会，游我带着原七小等人进入了矿山一探究竟。
进入到矿洞深处的七小众人因为路标丢失和口渴的原因，只得先坐下休息片刻，正当露明快要因为口渴误喝矿洞自然水时，恐龙部的亨特和改造君出现并制止了露明。改造君出逃并找到尼尔后，向尼尔说明了现况，尼尔认为答案可能就埋藏于哥哈市周边的地下，于是便委托亨特利用寻宝的天赋前来帮助游我等人。在亨特发现“宝藏”后的一个喷嚏下，游我等人发现了一条神秘的密道。路上几人闲聊时，游我认为麻奈想要消除超速决斗，除了珍惜传统，一定还有其他的原因，只要解开道路前方的秘密，就一定能让六小的大家和麻奈露出笑容了。此时卢克和亨特发现了一处奇怪的地方，而加里安和舒贝尔便在这个重骑角斗场等待着他们。
因为各种乌龙（）搞出来的麻烦而且游我似乎早就预知到了），在兰世和凛之介的姐弟决斗过后，舒贝尔继续对战游我等人，为了一报之前被舒贝尔的伙伴陷鸽欺骗的仇，卢克主动接受与舒贝尔的决斗。然而途中因为舒贝尔和陷鸽的各种陷阱和骗术，卢克陷入了陷鸽的精神迷宫无法逃出，但在游我的呼唤和鼓励下由于37集过于深井冰的节奏导致这集n站的弹幕看到卢克想象中散发圣光的游我后，开始刷起了奇怪的称呼（雾），卢克逃出了精神迷宫并一鼓作气将舒贝尔和陷鸽打倒后，游我等人穿过角斗场继续前进。
夺回麻奈的笑容（第38~39集）：
跟着亨特的指引继续向前的游我等人终于到达了矿山深处，这里埋藏着许多废弃的试制型决斗盘。根据尼尔的解释，在游我成功安装超速决斗程序的那一刻，给哥哈的所有系统带来了强烈的负荷，这引起了哥哈市周围地下含量丰富的特殊金属哥哈合金的反应，而冲击也因此传到了地下的废弃决斗盘里，因为极限召唤也算是超速决斗程序的一部分，所以废弃决斗盘也跟着一起更新了有关极限召唤的数据，从而诞生出极限卡。
此时麻奈和重骑决斗部的众人一同出现，表扬游我等人能够找到真相。麻奈表示虽然极限卡来自于这些决斗盘，但因为长年埋在地下和腐朽的原因，并不是每一张id卡都能够印出极限卡，「超掘机幻龙」便是在好几次试错下诞生出来的。尼尔也解释道就算没有腐朽的原因，也并不是每一张id卡都能够成功制造极限。为了验证麻奈说的话，游我尝试取出废弃决斗盘中的id卡，结果id卡因腐朽过重的原因一碰便碎。解释完毕后，麻奈再次向游我申请进行正式的超速决斗，如果游我赢了的话，便会如约解除六小学生的超速决斗禁令，如果麻奈赢了的话，则会让哥哈市所有的小学禁止超速决斗，并且是从七小开始。这就是大小姐的实力吗）
在决斗前，看着濒临报废的R6，游我再次向麻奈询问为什么会这么想击溃超速决斗呢。麻奈的答案还是和之前一样传统至上，认为后来加以修改的东西都是邪道。但是游我认为其中还有其他原因，正当游我还想继续说下去的时候，麻奈主动打断了对话，两人的决斗正式开始。
决斗开始后没多久，麻奈便召唤出了极限怪兽「超掘机幻龙」进行攻击，不过被游我用陷阱卡躲过一回。此时麻奈指出了游我的计划，并料到游我之前让改造君去到尼尔那里肯定还带来了仅存的另一只极限怪兽「世界树龙」，然而游我表示自己考虑了许多，最后还是决定不会使用「世界树龙」和麻奈对战改造君：我辛辛苦苦向尼尔磕头拿来的你竟然说不用，麻奈因此对游我失望。不过游我也没说过自己不会在这场决斗中使用极限卡，虽然熟练驾驭「世界树龙」的可能性很低，但游我选择了赌在更小的可能性上。
原来早在麻奈等人到来前的一小段时间，游我就借着亨特的发掘能力挖出了三个废弃决斗盘，幸运地拿到了三张状态良好的id卡，但能否成功印出极限仍是未知数。即便只是微小到令人绝望的可能性，也无法阻挡游我的王道，游我成功印出并召唤了「超限王道巨神」，这一系列举动让麻奈从心底里兴奋起来。在效果和陷阱卡的堆积下，「超限王道巨神」和「超掘机幻龙」的攻击力变为一致，两只极限怪兽本应会同归于尽，却因为id卡的故障出现了变数。在两只极限怪兽对撞的同时，麻奈的「超掘机幻龙」卡开始崩溃，终归是长期埋在地下的id卡，无法使用太长时间，如果「超掘机幻龙」消失的话，那么这场战斗就是「超限王道巨神」的胜利。然而与此同时，游我的极限卡也开始崩溃始终都是从地下挖出来的开始腐朽的id卡，无法支撑决斗太长时间，于是这场战斗变成了比哪边的极限怪兽先一步消失的决斗。
在一阵爆炸过后，两人的极限怪兽同时消失，于是这场战斗不分胜负，两人的决斗继续。在决斗中途，麻奈的R6再一次发生故障，无限接近于报废。游我觉得疑惑，询问麻奈为什么不修理R6呢。世世代代长期使用的重骑已有很多部件开始老化，现在光是连启动都勉强，而重骑的研发所六叶重机因为业绩下滑，被哥哈的重机制造部吞并，再加上哥哈不再对旧型重机提供技术支持，无法再生产可替换的部件，如果使用了其他部件的话，对麻奈来说无异于改造。游我察觉到麻奈等人想要击溃超速决斗的理由和“部件替换”有关，麻奈也答道哥哈公司答应他们，只要成功击溃超速决斗，就会重新生产六叶重骑部件，也可以复兴六叶公司。
决斗接近尾声，R6已经濒临极限，重骑决斗部的众人联合起来围住R6防止R6解体，这场决斗无论谁赢了，都会有一方失去最珍视之物。在游我的新王牌「幻明镜革新者」的攻击下，麻奈和重骑决斗部的众人彻底败北，R6也迎来了终焉，在决斗的最后彻底报废。何止报废，甚至直接爆炸了
或许这也是一种偶然，借着先前极限怪兽的战斗导致的爆炸和刚刚R6报废时产生的爆炸，游我找到了六叶公司隐藏起来的另一大秘密。在这矿山深处隐藏的另一个与王道研究所相似氛围的房间内，摆放着最早的决斗装置——六叶式移动决斗装置 R0号。之前游我在六小的图书馆调查时，偶然了解到R0号的存在，觉得如果能找到R0号的话，绝对能给麻奈带来笑容。在哥哈市还是一片平原的时候，在哥哈的开发大发异彩的便是六叶重机，在那之后六叶重机也同样参与了哥哈决斗的研发并提出了“无论到哪里都能自由地开始决斗”的装置的灵感。然而时代变迁，随着无人机技术进步，城市建设等方面不再需要重机，六叶公司的业绩开始下滑，最终被哥哈公司吞并。大家能像现在这样使用决斗盘享受决斗，六叶公司功不可没，其贡献也理应得到更高评价。
学人和露明发现R0就像游我的「王道」一样，到处都是些东拼西凑的零件，像是被不断改造过一般。游我向麻奈等人说明，在制作新事物的时候，总是需要一次又一次的失败，需要一次又一次的改造，努力到最后，才能有所成就。为了告诉麻奈等人这个道理，游我在想着解除禁令和回到七小的同时也在想着找到R0，告诉麻奈改造并不一定是邪道，超速决斗也是如此，R0也是如此。第六小学的决斗禁令取消，超速决斗部和学生会也能回到七小了。麻奈等人重新接受了“改造”一事，游我在改造完R6让R6重获新生后也答应了加里安重新改造他的重机，麻奈再一次找回了发自内心的笑容。
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