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動畫第3集的回憶揭示，喪屍爆發當天她因為補習而和慈姐留在教室里，隨後慈姐得知變故發生的消息，以「電車停運」為由勸由紀不要急著回家。之後由紀因為肚子餓，拉上慈姐一起到頂樓園藝部的菜園找小西紅柿吃（也因此才沒有直接回家而遭遇喪屍，由紀和慈姐相互救了命），在那裡遇到當時屬於園藝部的悠里。之後由紀在天台親眼目睹到操場上同學們變成喪屍的場景，見到遠處的爆炸和濃煙，以及喪屍衝擊天台大門，還見證了胡桃用鏟子斬殺喪屍學長，抱住胡桃阻止胡桃鞭屍後，精神開始崩潰，抱住胡桃不知所措地哭泣。
動畫第1集前20分鐘為由紀的退行視角，在9分25秒處黑板上的英文表達了由紀真實的內心想法。
黑板上的文字（細思極恐）[點擊展開/收起]
I enjoyed studying with everyone.（我十分享受（過去）和大家一起學習。）
Let's study together again.（讓我們再一次一起學習吧。）
But it done not come all true at all.（但這一切（已經發生的現實）都不是真的。）
All is in the darkness in the past.（一切都處於過去的黑暗之中。）
Please don't throw me away.（請不要丟下我一個人。）
Help me.（救救我。）
動畫第10集，胡桃的回憶中，慈姐告訴她要成立學園生活部的時候，胡桃打趣到「只知道哭著不停的那傢伙說不定也能變得更有精神一些」，這很顯然指的是由紀。因此可以推測在由紀倖存初期得不到精神寄託和安慰，精神一度處於惡化狀態；
同樣是第10集，里姐的回憶中揭示慈姐為了保護她們三人犧牲自己之後，由紀「也是從那時起變成這樣的」（也就是一度產生了學校和校園生活一切安好、慈姐還好好地活著的幻覺），並常常和只有她自己能看到的「慈姐」對話。
第6集直樹美紀加入學園生活部後，由紀似乎時不時的能夠認識到事實，與幻想中的慈姐的互動也越來越少。
（OP也逐漸表露真相，從第二集OP開始，間奏中出現的喪屍越來越多（2-6,7-9,10,11數量不同，注意10,11集主角團隊和太郎丸的表現也不同，第7集之後間奏切換的動畫亦不同）。第2集之後同學變成了喪屍，第4集之後圭變成喪屍，第7-9集慈姐變為十字架、第10,11集變為喪屍，太郎丸10,11集消失。第7集之後，學園生活部右下角慈姐被擦去，出現的照片變得較為壓抑，鴿子的顏色亦有變化。最後由紀腳下的顏色也逐漸變成血色（1-6,7-9,10,11顏色不同））
到第10集，由於雨天，喪屍大舉進入教學樓，由紀走到窗邊被雨水沾濕臉龐後意識到窗戶碎了，似乎開始對真相覺醒。
第11集，在喪屍的大規模入侵的危急情況下覺醒，對美紀描繪了美好的前景，給了她前往地下室取解藥，挽救眾人的勇氣。但其後由紀又因為擔心外出不歸的美紀而帶著球棒出動，在意念中慈姐的指引下前往廣播室，看到了慈姐自我犧牲時留下的血跡，說出「Byebye慈姐」做了最後的告別。
第12集，前往廣播室途中遭到喪屍襲擊，嘗試用棒球棒反擊喪屍但完全沒有效果，被喪屍化的太郎丸所救，之後用自己的帽子裹住太郎丸將它鎖到柜子里。在廣播室發出放學廣播，將聚集到學校的喪屍驅散，化解了危機。隨後，與學園生活部眾人從學校「畢業」，畢業式中將頭髮紮成了萌萌噠短雙馬尾。
痊癒以後安然離世的太郎丸和由紀沾了血的帽子一同被埋葬在學校屋頂。
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